事業用資産の買換え特例の計算は、譲渡資産の譲渡価額（Ａ）と買換資産の取得価額（Ｂ）をはじめに比較します。Ａ≦Ｂ、つまり新しく取得した買換資産の取得価額のほうが大きい場合は以下の算式により課税譲渡所得を計算し、税金を計算します。
計算式：
譲渡資産の譲渡価額×２０％－（譲渡資産の取得費+譲渡費用）×２０％
- 例：長期間保有していた土地から特定の資産への買換えの場合
- 譲渡資産の譲渡価額（Ａ） ５億円
- 買換資産の取得価額（Ｂ） ６億円
- 譲渡資産の取得費（Ｃ） １億円 減価償却相当額控除後
- 譲渡費用（Ｄ） ２，５００万円
- ５億円×２０％－（１億円＋２,５００万円）×２０％＝７,５００万円
- 所得税：７．５００万円×１５％＝１，１２５万円
- 住民税：７，５００万円× ５％＝ ３７５万円
また、Ａ＞Ｂという場合もあります。この場合には少し計算がややこしくなります。計算式は以下のようになります。
計算式：
（Ａ－Ｂ×８０％）－ C ＋ D × （A－B×80％ ）/ A
（Ａ－Ｂ×８０％）－ C ＋ D × （A－B×80％ ）/ A
- 例：
- 譲渡資産の譲渡価額（Ａ） ５億円
- 買換資産の取得価額（Ｂ） ４億円
- 譲渡資産の取得費（Ｃ） １億円 減価償却相当額控除後
- 譲渡費用（Ｄ） ２，５００万円
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